Genetická determinace spontánně regredující infekce virem hepatitidy C
Infekce virem hepatitidy C (HCV) může spontánně regredovat, ovšem v případě perzistující infekce signifikantně zvyšuje riziko cirhózy jater a hepatocelulárního karcinomu.
Infekce virem hepatitidy C (HCV) může spontánně regredovat, ovšem v případě perzistující infekce signifikantně zvyšuje riziko cirhózy jater a hepatocelulárního karcinomu. Ačkoli existují dílčí studie, které ukazují, že perzistující infekce je častější u afrických etnických skupin a u nositelů specifických genetických polymorfismů genu pro interleukin 28B, genetická predispozice pro spontánní regresi, respektive perzistenci infekce HCV nebyla dosud systematicky analyzována.
Cílem této dvoustupňové celogenomové asociační studie byla identifikace genetických determinant spontánní regrese infekce virem hepatitidy C. Zahrnuto bylo 919 osob se sérovými protilátkami proti HCV, ale bez přítomnosti RNA HCV (spontánní regrese) a 1 482 osob s přítomností jak protilátek proti HCV, tak RNA HCV (perzistentní infekce) dohromady z 13 center. U každého byl stanoven genotyp pro 792 721 jednonukleotidových polymorfismů (single nucleotide polymorphism, SNP), pokrývajících celý genom.
Po porovnání frekvencí SNP mezi oběma skupinami byly identifikovány signifikantní signály na chromozomech 19q13.13 a 6p21.32. Na chromozomu 19 vykázala nejsilnější asociaci oblast asi 55 tisíc bází blízko genu pro interleukin IL-28B (alelické OR pro SNP rs12979860 0,45; P = 2,17 × 10–30). Na chromozomu 6 se frekvence alel mezi osobami se spontánní eradikací HCV a perzistující infekcí nejvíce lišily v oblasti hlavního histokompatibilního komplexu blízko genů kódujících antigeny II. třídy HLA (DQB1*03:01). Celá oblast zahrnovala 117 SNP na úseku delším než milion bází, nejsignifikantněji byl asociován protektivní polymorfismus rs4273729 (alelické OR, 0,59; P = 1,71 × 10–16). Obě asociace byly nezávislé a bylo možné pomocí nich vysvětlit 14,9 % spontánních eliminací HCV u osob s evropskými předky a 15,8 % u osob s africkými předky. Podařilo se rovněž validovat asociaci SNP na 6. chromozomu v nezávislém vzorku 745 subjektů.
Závěrem lze shrnout, že byly identifikovány nezávislé polymorfismy v genech II. třídy HLA systému a IL-28B asociované se spontánní eliminací infekce HCV a konkrétní identifikované varianty mohou vysvětlit až 15 % případů této spontánní regrese.
(onse)
Zdroj: Duggal P., Thio C. L., Wojcik G. L., Goedert J. J., Mangia A., Latanich R., Kim A. Y., Lauer G. M., Chung R. T., Peters M. G., Kirk G. D., Mehta S. H., Cox A. L., Khakoo S. I., Alric L., Cramp M. E., Donfield S. M., Edlin B. R., Tobler L. H., Busch M. P., Alexander G., Rosen H. R., Gao X., Abdel-Hamid M., Apps R., Carrington M., Thomas D. L. Genome-wide association study of spontaneous resolution of hepatitis C virus infection: data from multiple cohorts. Ann Intern Med. 2013 Feb 19; 158 (4): 235–45.
